本病目前尚无公认的有效根治办法。多种药物均有效，但停药后大多易复发。治疗目的在于控制现有症状，防治重要脏器损害，减缓疾病进展。一般在急性活动期，应卧床休息。发作间歇期应注意预防复发。如控制口、咽部感染，避免进食刺激性食物。伴感染者可行相应的治疗。
1.局部治疗：口腔溃疡可局部用糖皮质激素膏、冰硼散、锡类散等;生殖器溃疡用1：高锰酸钾溶液清洗后加用抗生素软膏;眼结、角膜炎可应用糖皮质激素眼膏或滴眼液，眼色素膜炎须用散瞳剂以防止炎症后粘连，重症眼炎者可在球结膜下注射肾上腺皮质激素。
2.综合治疗
(1)非体抗炎药：对缓解发热、皮肤结节红斑、生殖器溃疡疼痛及关节炎症状有一定疗效。
(2)秋水仙碱：对关节病变、结节红斑、口腔和生殖器溃疡、眼色素膜炎均有一定的治疗作用。应注意肝肾损害、粒细胞减少等不良反应。
(3)沙利度胺：用于治疗严重的口腔、生殖器溃疡。一般小剂量开始，25-75mg，睡前口服。妊娠妇女禁用，另外有引起神经轴索变性的副作用。
(4)糖皮质激素：对控制急性症状有效，重症患者如严重眼炎、中枢神经系统病变、严重血管炎患者可考虑采用静脉应用大剂量甲泼尼龙冲击，mg/d，3-5天为1个疗程，与免疫抑制剂联合效果更好。长期应用糖皮质激素应注意其不良反应。